Met MINOX-Automatische betalingen kun je betaalopdrachten vervaardigen vanuit MINOX. Deze betaalopdrachten worden in een bestand opgeslagen. Dit bestand kun je bij de bank in lezen om het vervolgens daar te verwerken. Indien je een automatische bankenkoppeling in je administratie hebt, kun je er ook voor kiezen de betaalopdrachten naar Bizcuit te sturen, waar je de betalingen kunt goedkeuren zodat Bizcuit ze aan de bank ter verwerking aanbiedt. Zie Bizcuit en Minox  en Minox Koppelen met Bizcuit voor meer informatie.

Alle gegevens voor het vervaardigen van betaalopdrachten zijn in de MINOX-administratie aanwezig, zoals crediteurennummer, factuurnummer, factuurbedrag, banknummer en betalingskenmerk. Aan de hand van deze gegevens en de vervaldatum van de openstaande posten doet MINOX een voorstel tot betaling.

Voordat de betalingen definitief worden verwerkt, kun je een betalingsvoorstel wijzigen. Zo kunnen bedragen worden gewijzigd (deelbetalingen), kan betalingskorting worden toegepast en kunnen posten worden verwijderd of toegevoegd. Nadat alle wijzigingen zijn aangebracht, kun je het betalingsvoorstel definitief verwerken. Niet alleen worden dan de betaalopdrachten klaargezet, ook je financiële administratie wordt volledig bijgewerkt.

De betaalopdrachten worden klaargezet in één bestand (in het SEPA-formaat).